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En esta área se lidera la agenda científica institucional con los lineamientos y objetivos propuestos por CINDESUS. dentro de estos está el generar conocimiento aplicable a los proyectos de desarrollo sustentable, utilizándolo para la toma de decisiones en lo pertinente a transformar los territorios y su relación con el funcionamiento de los ecosistemas, la planificación, la gestión ambiental de los territorios, la participación activa de la comunidad y la apropiación del conocimiento recopilado en las actividades del centro de investigación.